變構蛋白質代謝相互作用的系統(tǒng)鑒定，體內控制酶的活性。

·鏈接，卡爾Kochanowski，Uwe Sauer

發(fā)表于23455438

摘要

最近的數據表明，大多數的蛋白質結合特定的代謝產物，這種相互作用是相關的代謝和基因調控。然而，有沒有方法來系統(tǒng)地識別變構蛋白質代謝的相互作用。在這里，我們提出一個實驗和計算方法使用動態(tài)代謝數據發(fā)現變構調節(jié)體內相關。通過切換的培養(yǎng)條件下大腸桿菌每30秒之間的介質含有14C-果糖或葡萄糖或丙酮酸或（13），我們測量逆轉磁通通過糖酵解途徑和觀察到的快速變化的代謝物濃度。我們適應這些數據對糖酵解的動力學模型和系統(tǒng)測試126個變構相互作用對代謝動力學的影響。我們確定的變構作用支配糖異生、糖酵解之間的可逆開關，包括一個由丙酮酸激活果糖-1,6 -二磷酸酶。因此，從大的假定的變構相互作用，我們的方法可以確定最有可能的，提供有關其功能的假說。